マニュアルの エディタ[マップ] にはこう書いてあります。
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「ダンジョン」タブ内の「マップ」タブでは、各階のマップについて設定します。
これはダンジョンリストの一部ですので、変更した後は「ダンジョン」タブにて
ダンジョンリストを更新して下さい。
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というわけで、ダンジョンのマップやイベントを更新すると、その親リストにあたる
ダンジョンも更新待ち状態になりますので、rewriteボタンを押して更新して下さい。